Po intenzívnej teologickej príprave bol 20. februára 1529 vysvätený za kňaza. Už počas svojej prvej svätej omše mal videnie anjelov, čo predznamenalo jeho neobyčajný mystický život. Odišiel do Milána, kde sa stal duchovným vodcom grófky Ludoviky Torelliovej. V tomto prostredí plnom náboženskej ľahostajnosti začal horlivo kásať a organizovať duchovnú obnovu. Spolu s Bartolomejom Ferrarim a Jakubom Morigiom založil v roku 1530 Kongregáciu pravidelných klerikov svätého Pavla, ktorých ľudia podľa ich materského chrámu svätého Barnabáša začali volať barnabiti. Antonovým cieľom bolo pretvoriť vtedajšie kňazstvo podľa vzoru apoštola Pavla, ktorého listy nesmierne miloval a neustále z nich čerpal inšpiráciu.
Jeho apoštolský zápal sa nezastavil len pri kňazoch. Pre rehoľné sestry založil s pomocou grófky Torelliovej Vetvu angelík (Anjelky svätého Pavla) a pre laikov, najmä pre manželské páry, založil Spoločenstvo svätého Pavla. Týmto vizionárskym krokom predbehol svoju dobu, keď zapojil všetky vrstvy Cirkvi do spoločného diela evanjelizácie. Anton bol taktiež veľkým šíriteľom úcty k ukrižovanému Kristovi a k Eucharistii. Zaviedol zvyk zvoniť na kostolných zvonoch každý piatok o tretej popoludní na pamiatku Kristovho umierania a výrazne prispel k rozšíreniu štyridsaťhodinových eucharistických pokôn pred Najsvätejšou sviatosťou oltárnou.
Neúnavná práca, prísny asketický život, neustále cestovanie a urovnávanie sporov však rýchlo podkopali jeho už aj tak krehké zdravie. Keď počas jednej z misií vo Guastalle vážne ochorel, požiadal, aby ho previezli do rodnej Cremony, do domu jeho matky. Obklopený svojimi vernými spolubratmi a milovanou matkou zomrel v povesti svätosti dňa 5. júla 1539 vo veku necelých 37 rokov. Jeho sviatok slávime práve v deň jeho odchodu do večnosti, 5. júla. Za svätého ho vyhlásil pápež Lev XIII. v roku 1897 a jeho neporušené telo odpočíva v krypte kostola svätého Barnabáša v Miláne.
-----
Modlitba k svätému Antonovi Máriovi Zaccariovi 〉 Svätý Anton Mária, lekár tiel i duší, ty si s horiacim srdcom šíril lásku k ukrižovanému Kristovi a k Najsvätejšej sviatosti. Nauč nás milovať Božie slovo tak, ako si ho miloval ty, a daj nám odvahu pretvárať naše životy i naše okolie podľa evanjelia. Vypros nám u Boha dar pravej pokory, horlivosti vo viere a hlbokej úcty k Eucharistii, aby sme vo svojich blížnych vždy videli trpiaceho Krista. Pomáhaj nám svojím orodovaním, aby sme vytrvali v dobrom až do konca našich dní. Amen.
Liturgická modlitba 〉 Pane a Bože náš, ty si dal svätému kňazovi Antonovi Máriovi hlboké poznanie spasiteľnej vedy Ježiša Krista a urobil si ho v tvojej Cirkvi neúnavným kazateľom; daj, prosíme, aby sme na jeho príhovor správne chápali tvoju pravdu a svedectvom svojho života ju ohlasovali svetu. Skrze nášho Pána Ježiša Krista, tvojho Syna, ktorý je Boh a s tebou žije a kraľuje v jednote s Duchom Svätým po všetky veky vekov. Amen.
Zamyslenie 〉 Život svätého Antona Máriu Zaccariu nám pripomína, že skutočná obnova spoločnosti alebo Cirkvi sa nikdy nezačína vonkajšími reformami, ale premenou vlastného srdca. Anton bol lekárom, no rýchlo pochopil, že najväčšie rany ľudstva nie sú tie na tele, ale tie na duši - hriech, ľahostajnosť a duchovný chlad. Dnes žijeme v dobe plnej hlučnosti a povrchnosti, kedy máme tendenciu hľadať chyby všade okolo seba. Tento mladý svätec nás však pozýva zastaviť sa pod krížom, stíšiť sa pred eucharistickým Kristom a načerpať silu z Božieho slova. Ukazuje nám, že svätosť nie je vyhradená pre starobu či prežitie dlhých desaťročí, ale meria sa intenzitou lásky a vernosti, ktorú vložíme do času, ktorý nám bol zverený.
Myšlienka sv. Antona Máriu Zaccariu 〉 Bežte ako blázni, nie k cieľom tohto sveta, ale ku Kristovi a k ukrižovanému Bohu.