Jeho cesta k řeholnímu životu však nebyla snadná a stala se velkým zápasem s vůlí jeho otce, který se odmítal vzdát snu o synově politické budoucnosti. Alois byl poslán na dvory do Mantovy, Ferrary a nakonec do Madridu, kde působil jako páže synů krále Filipa II. Všude tam se od něj očekávalo, že se zapojí do dvorského života, on však volný čas trávil studiem teologie, duchovní četbou a posty. Jeho neústupnost a hluboká víra nakonec otce zlomily. V roce 1585 se Alois oficiálně vzdal svého práva na knížecí titul i veškerého dědictví ve prospěch svého mladšího bratra Rudolfa a odešel do Říma, kde vstoupil do noviciátu Tovaryšstva Ježíšova, tedy k jezuitům.
Jako řeholník vynikal Alois mimořádnou poslušností a pokorou. Pro mladého muže zvyklého na obsluhu služebnictva bylo potěšením vykonávat ty nejprostší domácí práce a starat se o druhé. Jeho pozemská pouť se však dramaticky nachýlila ke konci, když v Římě na počátku roku 1591 propukla morová epidemie. Jezuité zřídili pro nemocné nemocnici, kde Alois s nesmírným nasazením osobně omýval nakažené, stlal jim lůžka a připravoval je na svatou zpověď. Při této obětavé službě se sám morem nakazil. Přestože první nápor nemoci přežil, jeho organismus byl fatálně oslaben. Po třech měsících trpělivě snášeného utrpení, během nichž neustále upíral zrak na kříž, zemřel 21. června 1591 ve věku pouhých třiadvaceti let s Ježíšovým jménem na rtech. Roku 1726 byl prohlášen za svatého a později byl ustanoven patronem křesťanské mládeže a studentů.
-----
Modlitba za čistotu srdce 〉 Svatý Aloisi, ty jsi uprostřed svůdného a marnivého světa dokázal uchovat své srdce čisté a neporušené. Shédni na mě, který denně zápasím s pokušením a slabostmi lidské přirozenosti. Vypros mi u Boha milost, abych dokázal chránit své smysly, ovládat své touhy a vidět v druhých lidech Boží obraz. Pomáhej mi žít v pravdě a vnitřní svobodě, aby mé myšlenky i skutky směřovaly k oslavě našeho Pána. Kéž pod tvou ochranou kráčím cestou upřímné lásky a čistého svědomí po všechny dny svého života. Amen.
Modlitba za mladé lidi a studenty 〉 Svatý Aloisi, patrone mládeže, obracím se k tobě s prosbou za všechny mladé lidi, kteří v dnešním složitém světě hledají smysl svého života a správný směr. Ty jsi měl odvahu jít proti proudu a vyměnit pozemské bohatství za nebeský poklad. Vypros jim dar moudrosti při rozhodování o budoucnosti, sílu vytrvat v dobrém a odvahu hájit morální hodnoty. Provázej studenty v jejich úsilí o vzdělání, aby své vědomosti rozvíjeli nejen pro svůj prospěch, ale především pro službu bližním a k větší oslavě Boží. Amen.
Zamyšlení 〉 Život svatého Aloise Gonzagy nám staví před oči provokativní otázku, co má v lidském životě skutečnou váhu. V dnešní době, která je často zaměřena na výkon, sbírání zážitků, uznání a materiální zajištění, působí tento mladý šlechtic jako zjevení z jiného světa. On sám měl vše, po čem lidé touží - moc, bohatství, společenské postavení a zajištěnou budoucnost. Přesto dokázal nahlédnout pod povrch tohoto lesku a rozpoznal, že skutečné štěstí leží v radikálním odevzdání se Bohu a v tiché službě těm nejubožejším. Jeho odchod od knížecího dvora k lůžkům umírajících na mor nebyl projevem mladické naivity, ale výsledkem hluboké vnitřní zralosti a lásky, která se nebojí přinášet oběti. Aloisův příklad nás učí, že svatost není záležitostí věku, ale opravdovosti srdce. Připomíná nám, že i uprostřed hlučného a náročného prostředí si člověk může zachovat vnitřní ticho, čistý štít a soucit s trpícími, pokud má svůj život pevně ukotvený v modlitbě a důvěře v Boha.